Por sus presuntos vínculos con el Bloque Calima de las AUC, la Procuraduría formuló pliego de cargos  contra el ex senador Juan Carlos Martínez Sinisterra.

La Procuraduría General de la Nación formuló pliego de cargos al señor Juan Carlos Martínez Sinisterra, en su condición de senador de la República de Colombia, por sus posibles vínculos con grupos paramilitares de los cuales habría obtenido un favorecimiento electoral, específicamente de integrantes del Bloque Calima de las Autodefensas Unidas de Colombia (AUC).

El entonces senador habría obtenido apoyo en su campaña al Congreso de 2002 "gracias a la solicitud que le fuera elevada por reconocidos narcotraficantes de ese sector del país y que posteriormente en las elecciones congresionales de 2006, cuando el grupo paramilitar ya se había desmovilizado, Juan Carlos Sinisterra se benefició del apoyo electoral que pudo otorgarle para ese entonces organizaciones narcotraficantes apoyadas por los reductos no desmovilizados de las AUC, cuyo epicentro principal fue el municipio de Cartago, Valle".

Los vínculos del señor Martínez Sinisterra con miembros del Bloque Calima fueron confirmados por el excomandante paramilitar Hebert Veloza, alias "HH", en versión rendida ante la Unidad Nacional de Justicia y Paz el 8 de junio de 2008, quien señaló que en el año 2002, el entonces senador hizo un acuerdo político con su agrupación ilegal para que resultara elegido en el periodo 2002-2006.

De acuerdo con esta declaración, el grupo armado ilegal inició contactos con el señor Martínez Sinisterra a través del cabecilla político del Bloque Calima Carlos Efrén Guevara Cano, alias "Fernando Político", quien tenía a cargo la dinámica electoral y estaba encargado del manejo de los vínculos con servidores públicos y miembros de las Corporaciones municipales de elección popular, por parte de la autodefensas.

Con su conducta el exparlamentario habría promovido y auspiciado el señalado grupo paramilitar, su accionar delincuencial y su proyecto ideológico, atentado contra los fines del Estado, advirtió el Ministerio Público.