De acuerdo a los lineamientos establecidos en el Reglamento sobre la Organización del Arbitraje en las Asociaciones Miembro de la FIFA, el Comité Ejecutivo de la Fedefútbol es el único responsable del manejo del arbitraje en Colombia y  por intermedio de su Comisión Nacional Arbitral hace la administración del mismo.

A partir de esta conformación y acogiéndose al Reglamento de la FIFA, la Comisión ha venido trabajando y estructurando su función en torno a la reglamentación de las asociaciones arbitrales que puedan ser parte del fútbol nacional, reiterando que solamente bajo este concepto y bajo ninguna circunstancia, la organización, normas y desarrollo del arbitraje estarán bajo la supervisión o control de otros organismos o entidades, siempre pensando en el mejoramiento de la calidad e independencia del mismo en cuanto a las ligas, divisiones y demás entidades.