El investigador Octavio Casas aseguró, ante la Corte Suprema de Justicia, que tras revisar documentos del Ministerio de Agricultura sobre la realización del programa Agro Ingreso Seguro, encontró varias irregularidades cometidas por Andrés F. Arias.

De acuerdo con Casas, entre las irregularidades se encuentra, sin concepto alguno, la suscripción de subsidios del programa antes de que la respectiva ley lo permitiera, esto, según un documento encontrado en la Dirección de Comercio y Financiamiento del Ministerio de Agricultura,

La denuncia se realizó durante el juicio que enfrenta el exministro de Agricultura, Andrés Felipe Arias, por los delitos de peculado por apropiación de terceros y celebración de contratos sin cumplimiento de requisitos legales.