Tras el lío suscitado entre Colombia y Nicaragua por la soberanía territorial y delimitación marítima del Archipiélago de San Andrés, las relaciones diplomáticas y económicas entre los dos países se han visto afectadas, en donde los acuerdos comerciales se han dejado a un lado, dándole protagonismo a la disputa territorial.

De acuerdo con el informe de CVN, en los últimos dos años las relaciones comerciales entre Nicaragua y Colombia han tenido una variación importante: En el 2012 la balanza comercial para nuestro país fue deficitaria en 5 millones 953 mil  dólares, con exportaciones por 8 millones 790 mil dólares e importaciones por 14 millones 744 mil dólares, mientras que el balance entre enero y junio del presente año registró una balanza positiva para Colombia de 341 mil dólares, con importaciones por 4 millones 219 mil dólares y exportaciones de 4 millones 560 mil dólares.

Las cifras reveladas indican que el intercambio comercial entre los dos países, los últimos cuatro años de enero a junio han presentado la siguiente variación:

En el 2010 llegaron productos por un valor de 2 millones 018 mil dólares, mientras que las exportaciones Colombianas al país Nicaragüense fueron de 3 millones 649 mil dólares (Valor FOB).

Para el 2011 las importaciones tuvieron un crecimiento del 131% por 4 millones 633 mil dólares y exportaciones por un saldo de 5 millones 975mil dólares y un crecimiento del 64%, en el año siguiente las importaciones tuvieron un buen índice alcanzando los 7.262 miles de dólares y un crecimiento del 56%, mientras que para nuestro país no fue muy favorable, pues le vendió al país vecino 4 millones 207 mil dólares con un decrecimiento del 30%. 

Los bienes consumidos por los miembros del país nicaragüense en el 2012, según José Esteban Rojas, Director de Investigación y Desarrollo de CVN,  fueron productos farmacéuticos, seguido por aceites esenciales y preparaciones de perfumería, productos editoriales y textos. En cuanto a los productos que más compró Colombia a Nicaragua durante el 2012, se encuentran las semillas y frutos, plantas, paja, seguido por productos de pastelería y los bienes de navegación marítima y fluvial, azucares, prendas de vestir, productos siderúrgicos, entre otros.