La Fiscalía General tomó la decisión de reversar el principio de oportunidad que había concedido a Manuel, Miguel y Guido Nule y a su socio Mauricio Galofre. Por lo tanto, el ente investigador les imputará cargos por cohecho, fraude, falsedad y concierto para delinquir.
Así mismo, la Fiscalía les imputó nuevos cargos por un millonario crédito que consiguieron en la Dirección Nacional de Estupefacientes. En este proceso, los Nule fueron sindicados por delitos de contrato sin cumplimiento de requisitos legales, peculado por apropiación y falsedad ideológica en documento público.
Los procesos contra los Nule han sufrido retrasos por los más de diez aplazamientos debido a recursos interpuestos por sus defensores. Sin embargo, el Tribunal de Bogotá ya había condenado a los polémicos contratistas a 14 años de cárcel por el delito de peculado, único cargo que aceptaron ante la justicia.