La Corte Suprema de Justicia había emitido una condena de 9 años en su contra por el delito de concierto para delinquir agravado al firmar una alianza con el grupo armado ilegal en su carrera a la Gobernación de Santander.
Luego de las ¾ partes de la pena, un juez emitió la orden de libertad al exgobernador de Santander, Hugo Aguilar Naranjo por lo que podrá terminar su condena desde su casa.
Cabe recordar que en enero de 2011 la Procuraduría inhabilitó a Aguilar por 20 años para ejercer cargos públicos, después de considerar que existían pruebas de que se alió con los paramilitares de Santander y Puerto Boyacá para ser elegido Gobernador. Una de las exigencias que evidenciaba esta alianza fue el nombramiento de Bonel Patiño como secretario de Educación por un acuerdo previo con el jefe paramilitar Iván Roberto Duque, alias Ernesto Báez.