Teniendo en cuenta la obra de ingeniería tan compleja que se adelanta para la recuperación de la navegabilidad del río Magdalena, la Procuraduría General de la Nación ve con preocupación que los aspectos ambientales no sean transversales a las diferentes estrategias planteadas por las autoridades del país en relación con este proyecto de alto impacto social, económico y ambiental para Colombia.

Es por eso que el Ministerio Público, a través de su Procuraduría Delegada para Asuntos Ambientales y Agrarios, le recordó al ministro de Ambiente y Desarrollo Sostenible, Gabriel Vallejo López, que el ente de control en el 2013 presentó un informe denominado "Río Magdalena informe social, económico y ambiental", el cual tenía como objetivo caracterizar el estado social, económico y ambiental de la gran cuenca y que sirviera como insumo para fomentar la implementación de políticas públicas que promovieran su desarrollo sostenible.

Algunas de las recomendaciones presentadas en dicho informe señalan que: Se debe elaborar una política pública que integre aspectos sociales, económicos y ambientales, en la que el flujo de acciones y decisiones estén racionalmente focalizadas a darle solución a las problemáticas que se han diagnosticado en la región; los entes territoriales, en cabeza de sus gobernadores y alcaldes, deben dimensionar las funciones, atribuciones y competencias que en materia de defensa del medio ambiente les ha otorgado la Constitución Política de 1991 y el ordenamiento legal que la ha desarrollado; los planes regionales ambientales deben ser debidamente socializados, de manera tal que sirva de orientación y conocimiento para los diferentes actores involucrados de esta ecoregión que ejecuten políticas públicas, como lo son los departamentos y municipios.

De igual manera, se recomendó crear espacios para la concertación con la comunidad de planes y estrategias que conduzcan al desarrollo sostenible de la región; priorizar la protección de zonas vulnerables a la contaminación, deforestación y degradación en la cuenca del Río Magdalena; que las autoridades competentes establezcan una red de inventario, monitoreo y control de biodiversidad de las especies de la cuenca y del manejo de los ecosistemas que hacen parte de la región; y que las alcaldías municipales y las gobernaciones exploren alternativas de cuidado y conservación del río que pudieran funcionar como complemento a actividades económicas sostenibles con las que se conduzca al desarrollo de la zona.

El río Magdalena es la principal arteria fluvial de Colombia y el 49% de la población que habita a su alrededor depende directa o indirectamente de los servicios económicos y ambientales que esta proporciona.